Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mbd1Q9Z2E2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms