Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Upk1bQ9Z2C6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms