Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ddx39bQ9Z1N5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms