Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cpne6Q9Z140 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms