Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Xpr1Q9Z0U0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms