Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gbp2Q9Z0E6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gbp2Q9Z0E6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms