Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AireQ9Z0E3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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