Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnip1Q9WUU8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms