Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scnn1bQ9WU38 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms