Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn4Q9WU22 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ptpn4Q9WU22 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms