Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Psma4Q9R1P0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psma4Q9R1P0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms