Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2afyQ9QZQ8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2afyQ9QZQ8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms