Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp3Q9QY23 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms