Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nr2e3Q9QXZ7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nr2e3Q9QXZ7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms