Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cbx8Q9QXV1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms