Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad18Q9QXK2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms