Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trim44Q9QXA7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim44Q9QXA7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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