Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chaf1aQ9QWF0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms