Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcea2Q9QVN7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms