Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid2Q9QUS6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid2Q9QUS6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid2Q9QUS6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid2Q9QUS6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid2Q9QUS6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid2Q9QUS6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid2Q9QUS6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid2Q9QUS6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mid2Q9QUS6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mid2Q9QUS6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms