Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dkk3Q9QUN9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms