Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slamf1Q9QUM4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slamf1Q9QUM4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms