Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cln8Q9QUK3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cln8Q9QUK3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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