Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Crlf1Q9JM58 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms