Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms