Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nectin3Q9JLB9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Nectin3Q9JLB9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin3Q9JLB9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms