Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upk3aQ9JKX8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Upk3aQ9JKX8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms