Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nova1Q9JKN6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nova1Q9JKN6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms