Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms