Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sv2aQ9JIS5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sv2aQ9JIS5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms