Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dclre1aQ9JIC3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms