Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgi1Q9JIA1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms