Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cldn19Q9ET38 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn19Q9ET38 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms