Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhojQ9ER71 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhojQ9ER71 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhojQ9ER71 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhojQ9ER71 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms