Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn2Q9ER65 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms