Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Capn12Q9ER56 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms