Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stx12Q9ER00 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms