Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3a2Q9EQR4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.3 ms