Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cxcr6Q9EQ16 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cxcr6Q9EQ16 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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