Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP79

Vmn1r52, Vomeronasal type-1 receptor 52, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r52Q9EP79 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r52Q9EP79 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms