Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc38a3Q9DCP2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a3Q9DCP2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms