Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xab2Q9DCD2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms