Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tomm20Q9DCC8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tomm20Q9DCC8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms