Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne8Q9DC53 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cpne8Q9DC53 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms