Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CrotQ9DC50 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CrotQ9DC50 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms