Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9DAA3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q9DAA3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9DAA3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9DAA3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms