Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sgf29Q9DA08 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sgf29Q9DA08 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms