Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Actrt1Q9D9J3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms