Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tvp23bQ9D8T4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tvp23bQ9D8T4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms