Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Derl3Q9D8K3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms